L'Istituto degli Innocenti per le attività di ricerca e monitoraggio ha attivato negli anni collaborazioni con le seguenti istituzioni:
- Ministero del lavoro e delle politiche sociali
- Dipartimento per le politiche della famiglia della Presidenza del Consiglio dei Ministri, nell’ambito delle attività del Centro nazionale di documentazione e analisi per l’infanzia e l’adolescenza. Per il monitoraggio dello sviluppo dei servizi educativi per la prima infanzia.
- Dipartimento per le Pari Opportunità della Presidenza del Consiglio dei Ministri
- Commissione per le adozioni internazionali
- Regione Toscana, nell’ambito delle attività del Centro regionale di documentazione per l’infanzia